Ultimamente tenho feito algumas fotos em NEF+JPG e cada vez menos uso o JPG. Apesar disso os JPG's podem dar muito jeito para visualização rápida das fotos quando não temos nenhum programa instalado no SO.
O que reparei foi que existe uma diferença significativa entre o Capture NX2 da Nikon e o PhotoShop CS5.
Para ser sincero gostei muito mais do que faz o Capture NX2 dá mais contraste e cor nos NEF's por defeito.

Nikon NX2 Nef to JPG 90% por defeito tamanho 1000x670

Photoshop CS5 NX2 Nef to JPG por defeito (nivel 10 qualidade) tamanho 1000x670
Parece deixar as cenas muito lavadas obrigando a dar mais contraste e cor até o WB vem mais frio, pelo menos foi o que notei.
Não sei se é o mais adequado mas eu sempre trabalhei com o sRGB... apesar de ler em todo o lado que o Adobe RGB tem mais range dinâmico de cores.
A minha dúvida é se ao fotografar em NEF a escolha no equipamento entre os dois modos é que faz a diferença?! Porque em edição tanto no NX como no CS5 sinceramente não vejo nada de diferente. De qualquer maneira vou ver se faço uns testes e depois coloco aqui... mas deixem a vossa opinião.
NX2 vs PhotoShop
NX2 vs PhotoShop